Reaproveitar junta do cabeçote e parafusos é uma economia que não vale a pena. Sempre que desmontar tem que trocar parafusos e junta do cabeçote, pelo simples fato de que a alta temperatura provoca desgastes (diga-se constante dilatação e contração do material), fazendo o componente perder seu melhor ajuste.
Na primeira mexida, era pra ter mandado o cabeçote pra fazer um teste de trinca e empeno da retífica. Não vale a pena usar o silicone, pois não se sabe quanto tempo vai funcionar o enchimento, afinal não dá pra ficar desmontando cabeçote e olhando pro silicone. Manda pra retífica e manda encher as cavitações.
Quando for trocar a junta coloque sempre a original (ou de primeira linha) e a recomendada para o motor. Apesar de que eu acho que a junta do HS2.5 é diferente da do 2.8.