Já verificou se o sensor de temperatura do cabeçote está bom? Ele quem alerta ao módulo quando o cabeçote está em temperaturas elevadas demais e aciona a ventoinha elétrica.
O Duratec 2.3HE é um ótimo motor mas exige que tudo esteja funcionando adequadamente.
Verifique também se a tampa do reservatório está boa, muitas vezes ela não mantém a pressão adequada no sistema.