Eu lhe sugiro verificar se a caixa do filtro de ar está bem vedada, isto é, se a única entrada de ar é aquela que vem do snorkel. Digo isto, porque em alguns tipos de filtro não existe boa vedação e a água poderia entrar pelo encaixe da tampa ou até mesmo por outros buracos que possam existir na caixa do filtro e isto poderia ser importante dependento da profundidade e do tempo que ficar na água. Quando se coloca o snorkel normalmente se coloca algum tipo de cola (vai ficar mais difícil de abrir) no encaixe da tampa. Outro cuidado seria colocar snorkel (tubinhos) também nos diferenciais e se não me engano, no câmbio. Cabe ainda lembrar outros cuidados quando em alagados, como a hélice do radiador que pode ser entortada com a resistência da água e entrar radiador a dentro destruindo-o e que quando estiver dentro d'água não se dever pisar na embreagem (se bem que eu já fiz isto saindo da água e não deu problema). No mais o motorzão diesel não tem muita frescura na água.
Abraços.
Gildo.