Até um certo ano, sessenta e alto, o CJ só vinha com número no bloco do motor mesmo.
A maneira correta é, ANTES de comecar a troca de motor, solicitar no detran a remarcação do chassi. Não é qquer lugar que pode fazer, e pra fazer tem que ter um processo no detran. Procure um despachante experiente que o cara te ajuda.
Com o chassi marcado, fica muito mais fácil de fazer a papelada da troca do motor depois.