Também depende do tipo de uso principal que você quer dar para a viatura. Mais asfalto? Mais viagens longas? Mais trilhas? Trilha pesada? Dia a dia?
O Tdi (até ano 2000 ou 2002 se não me engano) é o motor mais simplão de todos, totalmente mecânico, manutenção mais em conta e mais fácil de achar mecânicos e peças.
Td5, mais potente, não conheço, mas ouço falar só bem, apesar de manut. um pouco mais cara. E seu som, acho uma belezura.
Puma, também acho show, mas é o mais modernão, com eletrônica embarcada, o que pode ser um problema com excessos de água (alagados, muita lama, etc), mas mesmo assim, muitos só elogiam.
Nesta ordem, também vai subindo os valores, pois esta cronologia de motorização segue os anos dos veículos. Tdi mais antigos, Td5 intermediários, Puma, os mais novos (de 2006 pra frente?).
Logo outros que sabem muito mais que eu postam mais infos aqui, boa sorte. Abraço.