A opção avião-carro alugado geralmente é mais econômica mesmo, estou planejando uma viagem para o mesmo período (Rio - Acre - Peru - Machu Pichu - Nasca - Lima). Inicialmente pensei em fazer com o meu carro, mas são 8 dias de ida e volta até Rio Branco... São 8 dias a menos de viagem e calculei que nesses 8 dias devo gastar uns R$ 4.500 (R$ 800 com hospedagem, R$ 800 com comida, R$ 2500 com combustível, R$ 300 com pedágios, mais outros valores menores). Só vale a pena se for uma família ou grupo de amigos...
Além do valor financeiro... são 8 dias a menos nas férias só de deslocamento. Agora já penso em fazer Rio - La Paz na Bolívia e alugar o carro lá para passear no Peru.
Sobre a sua viagem, legal o roteiro
Acho que a opção que ficará mais em conta será mesmo Natal - SP - Santa Cruz de La Sierra - Sucre.
O aluguel na Argentina é caro, no Chile mais ainda... Se quiser economizar para 28 dias de aluguel tem que ser na Bolívia mesmo.
Uma opção seria ir até Corumbá de avião e seguir de trem até Santa Cruz de La Sierra (trem da morte) e de lá de avião até Sucre (de S.Cruz até Sucre a passagem é bem em conta, tipo US$ 50...). Dependendo do trecho Natal-Corumbá pode ser a opção mais em conta.
Veja nesse as informações sobre esse trem
http://www.machupicchu.com.br/tudosobre/tm/tm.html
Eu faria "Uyuni - Atacama" indo pela Laguna Verde, vai passar pela Laguna Colorada, Deserto de Siloli, etc. paisagens imperdíveis. O caminho é mais "aventureiro" e off road, veja este link do meu blog
http://viagensaamericadosul.blogspot...ia-laguna.html
Outra dica é ir um pouco mais ao Sul de Fiambalá, até a cidade de Villa Union e conhecer os parques Ishigualasto e Talampaya (dá pra fazer os dois passeios no mesmo dia)
Vc já viu o meu blog? tem muita informação sobre essa região... Bolívia, Atacama e Norte da Argentina.
http://viagensaamericadosul.blogspot.com.br/